Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcbp2Q61990 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pcbp2Q61990 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcbp2Q61990 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcbp2Q61990 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcbp2Q61990 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms