Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2l1Q61985 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l1Q61985 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nfe2l1Q61985 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfe2l1Q61985 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms