Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lama3Q61789 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lama3Q61789 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lama3Q61789 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lama3Q61789 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lama3Q61789 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms