Protein–RNA interactions for Protein: Q61425

Hadh, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HadhQ61425 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HadhQ61425 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HadhQ61425 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HadhQ61425 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HadhQ61425 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HadhQ61425 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HadhQ61425 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HadhQ61425 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HadhQ61425 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HadhQ61425 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HadhQ61425 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms