Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kpna1Q60960 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kpna1Q60960 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kpna1Q60960 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kpna1Q60960 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kpna1Q60960 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kpna1Q60960 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kpna1Q60960 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms