Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vdac1Q60932 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vdac1Q60932 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vdac1Q60932 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms