Protein–RNA interactions for Protein: Q60847

Col12a1, Collagen alpha-1(XII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 3,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col12a1Q60847 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col12a1Q60847 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col12a1Q60847 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col12a1Q60847 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col12a1Q60847 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms