Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc5a6Q5U4D8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc5a6Q5U4D8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc5a6Q5U4D8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms