Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Scaf1Q5U4C3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Scaf1Q5U4C3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Scaf1Q5U4C3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Scaf1Q5U4C3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms