Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med13Q5SWW4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med13Q5SWW4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med13Q5SWW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med13Q5SWW4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med13Q5SWW4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Med13Q5SWW4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Med13Q5SWW4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med13Q5SWW4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms