Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r196Q5SVD5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r196Q5SVD5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms