Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ctc1Q5SUQ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctc1Q5SUQ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctc1Q5SUQ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctc1Q5SUQ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms