Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TefmQ5SSK3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TefmQ5SSK3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms