Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCP0

Rnf43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf43Q5NCP0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf43Q5NCP0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf43Q5NCP0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf43Q5NCP0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf43Q5NCP0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf43Q5NCP0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf43Q5NCP0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf43Q5NCP0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf43Q5NCP0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf43Q5NCP0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf43Q5NCP0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf43Q5NCP0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf43Q5NCP0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms