Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
L1td1Q587J6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1td1Q587J6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1td1Q587J6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1td1Q587J6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1td1Q587J6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
L1td1Q587J6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
L1td1Q587J6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1td1Q587J6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
L1td1Q587J6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L1td1Q587J6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms