Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10488Q4KL05 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm10488Q4KL05 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10488Q4KL05 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10488Q4KL05 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10488Q4KL05 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10488Q4KL05 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10488Q4KL05 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm10488Q4KL05 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm10488Q4KL05 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm10488Q4KL05 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm10488Q4KL05 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm10488Q4KL05 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm10488Q4KL05 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms