Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL04

Gm5168, Predicted gene 5168, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5168Q4KL04 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5168Q4KL04 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5168Q4KL04 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5168Q4KL04 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms