Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2K7

1700123L14Rik, RIKEN cDNA 1700123L14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123L14RikQ3V2K7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
1700123L14RikQ3V2K7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
1700123L14RikQ3V2K7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
1700123L14RikQ3V2K7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
1700123L14RikQ3V2K7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
1700123L14RikQ3V2K7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
1700123L14RikQ3V2K7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
1700123L14RikQ3V2K7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
1700123L14RikQ3V2K7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
1700123L14RikQ3V2K7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
1700123L14RikQ3V2K7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms