Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q7

Tmprss12, Transmembrane protease serine 12, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss12Q3V0Q7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmprss12Q3V0Q7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmprss12Q3V0Q7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmprss12Q3V0Q7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmprss12Q3V0Q7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms