Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed1Q3V009 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmed1Q3V009 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmed1Q3V009 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed1Q3V009 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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