Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubtfl1Q3USZ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubtfl1Q3USZ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ubtfl1Q3USZ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms