Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
B3gnt6Q3USF0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B3gnt6Q3USF0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B3gnt6Q3USF0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
B3gnt6Q3USF0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B3gnt6Q3USF0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
B3gnt6Q3USF0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B3gnt6Q3USF0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
B3gnt6Q3USF0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B3gnt6Q3USF0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
B3gnt6Q3USF0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
B3gnt6Q3USF0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms