Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nkain3Q3URJ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkain3Q3URJ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkain3Q3URJ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkain3Q3URJ8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms