Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl2Q3UMU9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms