Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttll12Q3UDE2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttll12Q3UDE2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ttll12Q3UDE2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll12Q3UDE2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttll12Q3UDE2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms