Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf180Q3U827 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf180Q3U827 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf180Q3U827 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rnf180Q3U827 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rnf180Q3U827 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
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