Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Palb2Q3U0P1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Palb2Q3U0P1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Palb2Q3U0P1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Palb2Q3U0P1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Palb2Q3U0P1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms