Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trmt1Q3TX08 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trmt1Q3TX08 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trmt1Q3TX08 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trmt1Q3TX08 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms