Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc127Q3TC33 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc127Q3TC33 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc127Q3TC33 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc127Q3TC33 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc127Q3TC33 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc127Q3TC33 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc127Q3TC33 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc127Q3TC33 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc127Q3TC33 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc127Q3TC33 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms