Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ap5b1Q3TAP4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap5b1Q3TAP4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ap5b1Q3TAP4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms