Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Jmjd8Q3TA59 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Jmjd8Q3TA59 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.6 ms