Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Prex2Q3LAC4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Prex2Q3LAC4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Prex2Q3LAC4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Prex2Q3LAC4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Prex2Q3LAC4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Prex2Q3LAC4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Prex2Q3LAC4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Prex2Q3LAC4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Prex2Q3LAC4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms