Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vax1Q2NKI2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vax1Q2NKI2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Vax1Q2NKI2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vax1Q2NKI2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms