Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Edem3Q2HXL6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Edem3Q2HXL6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Edem3Q2HXL6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms