Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Myo3bQ1EG27 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo3bQ1EG27 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Myo3bQ1EG27 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myo3bQ1EG27 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms