Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nkpd1Q0VF94 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nkpd1Q0VF94 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkpd1Q0VF94 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nkpd1Q0VF94 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkpd1Q0VF94 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkpd1Q0VF94 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkpd1Q0VF94 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkpd1Q0VF94 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkpd1Q0VF94 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkpd1Q0VF94 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nkpd1Q0VF94 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nkpd1Q0VF94 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms