Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Samd12Q0VE29 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Samd12Q0VE29 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Samd12Q0VE29 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.2 ms