Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc45a4Q0P5V9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc45a4Q0P5V9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc45a4Q0P5V9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc45a4Q0P5V9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a4Q0P5V9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a4Q0P5V9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a4Q0P5V9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a4Q0P5V9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a4Q0P5V9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc45a4Q0P5V9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc45a4Q0P5V9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc45a4Q0P5V9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms