Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sox4Q06831 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sox4Q06831 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox4Q06831 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox4Q06831 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms