Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a1Q05722 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col9a1Q05722 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col9a1Q05722 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col9a1Q05722 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms