Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnb1Q03717 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnb1Q03717 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnb1Q03717 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnb1Q03717 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms