Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scg2Q03517 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scg2Q03517 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scg2Q03517 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Scg2Q03517 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Scg2Q03517 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms