Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msx2Q03358 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msx2Q03358 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msx2Q03358 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Msx2Q03358 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms