Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Aplp1Q03157 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Aplp1Q03157 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Aplp1Q03157 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Aplp1Q03157 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Aplp1Q03157 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms