Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Nme2Q01768 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nme2Q01768 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme2Q01768 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme2Q01768 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms