Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sec23aQ01405 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sec23aQ01405 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sec23aQ01405 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sec23aQ01405 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms