Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gja5Q01231 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Gja5Q01231 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Gja5Q01231 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Gja5Q01231 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gja5Q01231 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gja5Q01231 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gja5Q01231 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gja5Q01231 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gja5Q01231 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gja5Q01231 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gja5Q01231 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gja5Q01231 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gja5Q01231 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gja5Q01231 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gja5Q01231 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gja5Q01231 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gja5Q01231 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gja5Q01231 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gja5Q01231 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gja5Q01231 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gja5Q01231 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gja5Q01231 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gja5Q01231 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gja5Q01231 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja5Q01231 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja5Q01231 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja5Q01231 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja5Q01231 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja5Q01231 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gja5Q01231 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gja5Q01231 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gja5Q01231 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gja5Q01231 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gja5Q01231 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gja5Q01231 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gja5Q01231 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms