Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grin2cQ01098 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Grin2cQ01098 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grin2cQ01098 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grin2cQ01098 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms