Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2cP97760 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2cP97760 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2cP97760 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2cP97760 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr2cP97760 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2cP97760 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2cP97760 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr2cP97760 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2cP97760 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2cP97760 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr2cP97760 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr2cP97760 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr2cP97760 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Polr2cP97760 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2cP97760 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms