Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas2P97460 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas2P97460 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas2P97460 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas2P97460 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Npas2P97460 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npas2P97460 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npas2P97460 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npas2P97460 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Npas2P97460 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas2P97460 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas2P97460 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npas2P97460 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npas2P97460 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npas2P97460 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas2P97460 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas2P97460 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Npas2P97460 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms